الگوی توزیع و چندشکلی ادغامی رتروترنسپوزون ها در جمعیت های linum austriacum l.

نویسندگان

حسین عباسی هولاسو

دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات، گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه بابک عبدالهی مندولکانی

دانشیار گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه مراد جعفری

دانشیار گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه ایرج برنوسی

دانشیار گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه

چکیده

رتروترنسپوزون­ها عناصر رایج در ژنوم گیاهان می­باشند که فراوانی، فعالیت و توزیع یکنواخت آنها در ژنوم، استفاده از آنها را به عنوان نشانگرهای مولکولی ایده­آل می­سازد. به­منظور مطالعه فعالیت، الگوی توزیع و چندشکلی ادغامی برخی رتروترنسپوزون­های ltr (long terminal repeat) در گیاه linum austriacum l. از نشانگرهای irap (inter-retrotransposon amplified polymorphism) و remap (retrotransposon-microsatellite amplified polymorphism) استفاده شد. نتایج نشان داد که رتروترنسپوزون­های ltr مورد استفاده به لحاظ انتقالی در ژنوم l. austriacum فعال بوده و در داخل یکدیگر به حالت آشیانه­ای و همچنین در نواحی نزدیک ریزماهواره­ها ادغام می­شوند. از 58 آغازگر منفرد و ترکیب آغازگری بررسی شده، 20 آغازگر (7 آغازگر irap و 13 آغازگر remap) الگوی باندی واضح و قابل امتیازدهی تولید نمودند. در مجموع 199 مکان توسط 20 آغازگر تکثیر شد که از این تعداد 129 مکان (8/64 درصد) چندشکل بودند. آغازگرهای ltr1868 و ltr1854-a13 به ترتیب بیشترین و کمترین تعداد مکان چندشکل را تولید نمودند. براساس آزمون مانتل همبستگی بین ماتریس­های کوفنتیک irap و remap معنی­دار نبود. تجزیه خوشه­ای براساس داده های حاصل از ترکیب دو نشانگر (irap+remap) به روش minimum evolution بر پایه ضریب number of differences، ژنوتیپ­ها را به چهار گروه منتسب کرد. افراد مربوط به هر جمعیت در گروه­های مشابه قرار گرفت. براساس نتایج حاصل از این تحقیق می­توان اظهار داشت که نشانگرهای irap و remap توسعه یافته براساس رتروترنسپوزون­های فعال در جنس linum می­توانند به عنوان ابزار نسبتاً جدیدی در برنامه­های اصلاحی گونه­های مختلف این جنس مورد استفاده قرار گیرند.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

فعالیت انتقالی و چندشکلی ادغامی رتروترنسپوزون ها در ارقام و لاین های گندم دوروم

رتروترنسپوزون ها عناصر متحرک رایج در ژنوم گیاهان بوده که گستردگی، توزیع یکنواخت و قابلیت جابه¬جایی، استفاده از آن ها را به عنوان نشانگرهای مولکولی ایده آل می سازد. در این مطالعه نشانگرهایirap و remap، مبتنی برخانواده¬های رتروترنسپوزونی ltr دار (گندم و جو) جهت مطالعه تنوع ژنتیکی 94 لاین و رقم بومی گندم دوروم (triticum turgidum l.) مورد استفاده قرار گرفتند. نتایج نشان داد که بیشتر خانواده¬های رتر...

15 صفحه اول

Flax (Linum usitatissimum L

The archaeological evidence of flax cultivation dates back to >6000 BC and it is considered as one of the oldest and most useful crops. Components of flax have diverse uses. Cultivar development of flax is currently focused on enhancing the oil content and nutritional value to meet the demand of nutraceutical market supply, as an alternate source of fish oil, a rich source of eicosapentaenoic a...

متن کامل

نوسانات جمعیت و الگوی توزیع فضایی شپشک Kermes quercus (L.) (Hem.: Kermesidae) در جنگل های بلوط گیلان‏غرب

شپشک Kermes quercus (L.) به­ طور اختصاصی از درختان بلوط تغذیه و خسارت وارد می­ کند. این شپشک درطی سال­های 94-1393 در جنگل­ های بلوط شهرستان گیلان غرب بر روی بلوط ایرانی، Quercus branti مطالعه شد. مراحل زیستی آفت از روی سرشاخه­ ها جمع آوری شد و در آزمایشگاه، در زیر استریومیکروسکوپ به تفکیک شمارش، ثبت و نوسانات جمعیت آن به صورت منحنی ترسیم گردید. همچنین توزیع فضایی و نوسانات جمعیت آفت با استفاده ...

متن کامل

چندشکلی ریزماهواره ای در جمعیت های ماهی خیاطه (Alburnoides eichwaldi) رودخانه های کبودوال و سفیدرود

ماهی خیاطه (Alburnoides eichwaldi) یک گونه رودخانه‌ ای است که در حوضه جنوبی دریای خزر از فراوانی نسبتا خوبی برخوردار می‌ باشد اما در بسیاری از آب ‌های اروپا نزدیک به انقراض می‌ باشد. تا کنون هیچ گونه مطالعه‌ ای در زمینه تنوع ژنتیکی این گونه صورت نگرفته است. در این تحقیق به منظور بررسی ساختار ژنتیکی ماهی خیاطه در رودخانه‌ های کبودوال و سفیدرود از 6 جایگاه ریزماهواره‌ای ...

متن کامل

Accumulation of lignans by in vitro cultures of three Linum species.

Justicidin B, an arylnaphthalene lignan, has strong cytotoxicity on chronic myeloid and chronic lymphoid leukemia cell lines. The first report of the production of justicidin B in a Linum species concerned in vitro culture of Linum austriacum. Therefore, culture characterization and presence of arylnaphthalene-type lignans in calli and plantlets of Linum tenuifolium from section Linastrum, Linu...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
فن آوری زیستی در کشاورزی

جلد ۶، شماره ۲، صفحات ۵۱-۶۱

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023